Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms