Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms