Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms