Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms