Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Slc6a20aQ8VDB9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Slc6a20aQ8VDB9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Slc6a20aQ8VDB9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Slc6a20aQ8VDB9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc6a20aQ8VDB9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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