Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms