Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ubxn4Q8VCH8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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