Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms