Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OptnQ8K3K8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms