Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrtm1Q8K377 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrtm1Q8K377 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrtm1Q8K377 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrtm1Q8K377 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrtm1Q8K377 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm1Q8K377 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm1Q8K377 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm1Q8K377 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm1Q8K377 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm1Q8K377 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm1Q8K377 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm1Q8K377 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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