Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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