Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mtmr3Q8K296 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mtmr3Q8K296 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mtmr3Q8K296 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mtmr3Q8K296 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mtmr3Q8K296 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mtmr3Q8K296 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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