Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms