Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pms1Q8K119 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pms1Q8K119 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pms1Q8K119 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms