Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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