Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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