Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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