Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn5Q8CBA2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn5Q8CBA2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn5Q8CBA2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn5Q8CBA2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn5Q8CBA2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms