Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms