Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col6a6Q8C6K9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col6a6Q8C6K9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col6a6Q8C6K9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col6a6Q8C6K9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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