Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC049762Q8C601 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms