Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11541Q8C4D8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11541Q8C4D8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms