Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nek11Q8C0Q4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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