Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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