Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjd4Q8BSD4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjd4Q8BSD4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms