Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144bQ8BKD6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144bQ8BKD6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144bQ8BKD6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144bQ8BKD6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144bQ8BKD6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf144bQ8BKD6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144bQ8BKD6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rnf144bQ8BKD6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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