Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune1Q8BIW1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms