Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms