Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms