Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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