Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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