Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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