Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms