Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b3Q6UQ17 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b3Q6UQ17 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b3Q6UQ17 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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