Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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