Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms