Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Usp49Q6P9L4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp49Q6P9L4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp49Q6P9L4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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