Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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