Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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