Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rbm38Q62176 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rbm38Q62176 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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