Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhocQ62159 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms