Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim27Q62158 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim27Q62158 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trim27Q62158 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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