Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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