Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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