Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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