Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
JrkQ60976 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms