Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp7Q60973 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms