Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms