Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms