Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc5a6Q5U4D8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms